Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms