Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA4P13612 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms