Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL6A2P12110 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms