Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOP2AP11388 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOP2AP11388 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms