Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYCNP04198 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MYCNP04198 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms