Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFB1P01137 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms