Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms