Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIN3BO75182 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms