Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF10O60809 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms