Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms