Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNMO15061 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNMO15061 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNMO15061 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNMO15061 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNMO15061 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms