Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms