Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms