Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJB4Q9UDY4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms