Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPG2Q9UBF2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms