Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms