Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms