Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDFQ9HBH1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms