Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms