Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms