Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC3Q9BY71 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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