Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF17Q9BXT8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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