Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C2orf88Q9BSF0 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms