Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM79Q9BSE2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms