Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms