Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOL4Q9BPW4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms