Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms