Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LGMNQ99538 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LGMNQ99538 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms