Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms