Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINGO1Q96FE5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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