Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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