Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAAF3Q8N9W5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms