Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC6Q8IVU3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms