Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLD3Q8IV08 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLD3Q8IV08 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms