Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PBRM1Q86U86 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBRM1Q86U86 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms