Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMUB2Q71RG4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms