Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RFPL4BQ6ZWI9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RFPL4BQ6ZWI9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms