Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VITQ6UXI7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms