Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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