Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms