Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms