Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms