Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms