Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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