Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms