Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNGA3Q16281 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms