Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ETFDHQ16134 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms