Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms