Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NPTX1Q15818 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NPTX1Q15818 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NPTX1Q15818 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NPTX1Q15818 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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