Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms